Herramienta de gestión de colas y tareas de procesamiento de neurodatos para la plataforma BrainSSys / Neurodata Processing Task and Queue Management Tool for the BrainSSys Platform

Las neurociencias constituyen un campo de la ciencia que estudia el sistema nervioso desde el funcionamiento neuronal hasta el comportamiento y cómo sus diferentes elementos interactúan. El Centro de Neurociencias de Cuba es la principal institución de investigación de neurociencia en el país, donde fueron identificadas distintas problemáticas asociadas al lanzamiento y gestión de colas de procesamiento de datasets de neurociencias. El procesamiento que se desarrolla sobre sus bases de datos se realiza de forma manual en sus servidores de HPC (High Performance Computer) debido a dificultades tecnológicas y financieras para acceder a los servicios que ofrecen las plataformas internacionales, por lo que los investigadores se ven obligados a programar instrucciones en consola para ejecutar tareas de procesamiento y análisis. El objetivo de la presente investigación fue desarrollar una herramienta que automatice el proceso de gestión de colas y tareas de procesamiento de neurodatos para la plataforma BrainSSys. Se empleó Python como lenguaje de programación, PyQt5 como marco de trabajo y se utilizó el editor de código Sublime Text 3. Se obtuvo como resultado una herramienta que permite automatizar la gestión de las colas de procesamiento en la plataforma BrainSSys. Las pruebas realizadas determinaron la aceptación y la evaluación funcional de la herramienta, siendo en ambos casos de gran valor para la calidad de la propuesta solución(AU)

Neuroscience is a field of science that studies the nervous system from neural functioning to behavior and how its different elements interact. The Cuban Neuroscience Centre is the main neuroscience research institution in the country, where different problems associated with the launch and management of neuroscience dataset processing queues has been identified. The processing of its databases is carried out manually on their HPC (High Performance Computer) servers due to technological and financial difficulties in accessing the services offered by international platforms, so researchers are forced to program instructions on the console to execute processing and analysis tasks. The aim of this research was to develop a tool that automates the queue management process and neurodata processing tasks for the BrainSSys platform. Python was used as programming language, PyQt5 and Sublime Text 3 as framework and code editor respectively. The result is a tool that automates the management of processing queues on the BrainSSys platform. The tests carried out determined the acceptance and functional evaluation of the tool, being in both cases of great value for the quality of the proposed solution(AU)

Funcionalidades de estadísticas y reportes para el Repositorio cubano de datos de neurociencias / Statistics and Reporting Functionalities for the Cuban Neuroscience Data Repository

Para la organización de bases de datos de Neurociencias se han realizado diversos proyectos en países desarrollados, entre estos los repositorios de datos. El Centro de Neurociencias de Cuba es la institución rectora de los estudios neurocientíficos en el país. Debido a los volúmenes de datos que se manejan en su repositorio se dificulta el manejo estadístico y la obtención de reportes. El repositorio carece de herramientas para el análisis estadístico del universo de datos almacenado, dificultando la toma de decisiones sobre los diferentes tipos de datos. En base a las deficiencias identificadas se decidió desarrollar un grupo de funcionalidades de estadísticas y reportes que permiten la extracción de información útil desde diferentes perspectivas, beneficiando a los científicos de neurociencias en el estudio y aplicación de escenarios para el tratamiento de los datos almacenados. Se realizó un análisis del estado del arte de las herramientas que permiten generar reportes y estadísticas de los datos almacenados en un repositorio o en una base de datos. Para el desarrollo se utilizaron tecnologías y herramientas como Visual Paradigm para el modelado, PostgreSQL para el manejo de los datos, Django como framework de desarrollo y el lenguaje de desarrollo Python. El resultado obtenido propiciará una herramienta con características similares a sus homólogas internacionales(AU)

Various projects have been carried out in developed countries for the organization of Neuroscience databases, including data repositories. The Cuban Neuroscience Center is the leading institution for neuroscientific studies in the country. Due to the volumes of data that are managed in its repository, statistical management and obtaining reports are difficult. The repository lacks tools for statistical analysis of the universe of data stored, making it difficult to make decisions about the different types of data. Based on the deficiencies identified, it was decided to develop a group of statistical and reporting functionalities that allow the extraction of useful information from different perspectives, benefiting neuroscience scientists in the study and application of scenarios for the treatment of stored data. An analysis of the state of the art of the tools that allow generating reports and statistics of the data stored in a repository or in a database was carried out. For the development, technologies and tools such as Visual Paradigm for modeling, PostgreSQL for data management, Django as a development framework and the Python development language were used. The result obtained will provide a tool with similar characteristics to its international counterparts(AU)